No, non esiste una connessione significativa tra di loro. In effetti, i Targaryen non adoravano nemmeno R'hllor.

Nello spettacolo non abbiamo sentito molto parlare di Valyria al suo apice (ancora), ma non sono riuscito a trovare alcuna prova che il culto di R'hllor era comune in Valyria prima che esplodesse. Valyria invece aveva una propria religione, dove la gente adorava un Pantheon di dei. Nei romanzi, ci viene detto che i Targaryen hanno chiamato i loro draghi dopo questi Antichi Dei, ad es. Balerion, Meraxes, Vhagar e Syrax. Per il resto, però, i Targaryen erano per lo più non religiosi, ma adottarono la maggior parte dei costumi della Fede dei Sette quando conquistarono Westeros.

Il fatto che entrambi siano fortemente collegati al fuoco sembra essere semplicemente il natura del fuoco come forza primaria, quindi è un motivo ricorrente con significati diversi in situazioni diverse.