No, Lucy non ha viaggiato nel tempo (anche se è stato anche il mio primo pensiero), né la sua mente ha rievocato quegli eventi. Lei le ricordava .
In tutto il film, il professor Norman spiega come lo scopo della vita sia trasmettere la conoscenza nel tempo. Dalla prima cella, alla sua divisione in due e alle forme di vita più complicate, lo scopo è sempre quello di trasmettere le informazioni.
Inoltre, tra i primi cambiamenti che Lucy sperimenta c'è il suo ricordo dei suoi primi anni di vita. (il gatto che aveva quando era una, il latte di sua madre, ...) che rivela nella sua conversazione telefonica con sua madre. Più tardi, quel ricordo spinge quindi agli eventi precedenti (la sua stessa crescita delle ossa).
La "sequenza del viaggio nel tempo" che vediamo è il processo di tutta la vita dal suo inizio, al contrario. Non finisce con il Big Bang. Termina con molte celle che si collegano (indietro) finché non ne rimane una, che è stata la prima cella in assoluto. L'intera sequenza è Lucy che ricorda tutta la conoscenza che è stata trasmessa da quella prima cella fino alle celle di oggi, e la salva comodamente in qualche forma su un computer.
Addendum: È stato notato nei commenti che aveva alcune interazioni con gli esseri della storia (indiani, dinosauri, antenati umani, ...) e che la vediamo in quelle interazioni, non i suoi antenati. Per come la vedo io è:
I ricordi sono di qualcuno. Hanno riconosciuto quella persona, non Lucy. La vediamo perché se lo ricorda.
Penso che sarebbe stato troppo confuso se in ciascuna di quelle brevi scene di interazione avessimo visto il vero antenato e il fatto che nessuno sembrava allarmato dalla sua improvvisa apparizione (che sarebbe una necessità se avesse viaggiato nel tempo) mi rende più certo che quegli umani e animali interagiscono con qualcuno che era naturalmente lì.